澳洲国立大学的创立是依据澳洲国会通过的专案法。该法案由当时的澳洲总理班·奇夫利以及二次世界大战战后重建委员会主任John Dedman所共同提出,并得到了反对党领袖罗伯特·孟席斯的全力支持,顺利于1946年8月1日获得通过。创校宗旨,在于建立一所顶尖的研究型国立大学,以提升澳洲的整体学术研究实力。ANU也成了澳洲唯一由联邦国会立法设立的国立大学(校名:National),不同于其它澳洲公立大学皆是由各地州议会立法设立。ANU成立后,大批杰出的澳洲学者们开始陆续加入ANU的创建行列,其中包括了在雷达开发与核物理领域中赫赫有名的Mark Oliphant爵士、青霉素的发现者Howard Florey爵士、历史学界的大师Keith Hancock爵士和著名的经济学者Herbert Cole Coombs爵士等等。创校初期,ANU致力于尖端科技的研发,并且只招收研究生。直到1960年将当时隶属于墨尔本大学的Canberra University College并入,才开始招收大学部学生。1979年创立ANU Enterprise,负责事业单位的营运,例如:科研专案承接、精密科学仪器生产等等。到了21世纪,在澳洲首都特区堪培拉的都市计划蓝图中,ANU主校区不仅仅是一般大学校区,同时也应规划设立ANU医学院和ANU附设医院。2001年4月,经过长达八个月的公共辩论和政府会议讨论,澳洲政府宣布挹注ANU成立澳洲第12所(世界第896所)医学院。经过几年发展,ANU医学院现已在澳洲的医学院中名列前茅。